Nastava podrazumijeva upis minimalno četiri kolegija po 6 ECTS bodova, po dogovoru i izboru doktoranda i studijskog savjetnika/mentora. Osim niže navedenih predmeta, doktorandi mogu birati i kolegije sa srodnih programa na Sveučilištu u Zagrebu, odnosno na drugim sveučilištima.
Razvijanje i stjecanje generičkih vještina ostvaruje se kroz obvezni kolegij ''Metodologija znanstvenog istraživanja'' (6 ECTS) koji uključuje predavanja i primjerene radionice.